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抗擊疫情新突破!AI診斷疑似病例基因分析縮短至半小時
2020/2/3 10:01:00   阿里云      關鍵字:疫情 AI診斷 基因分析      瀏覽量:
據悉,浙江此次啟用的全基因組檢測分析平臺可對病毒樣本進行全基因組序列分析比對,能夠有效防止病毒變異產生的漏檢,并將原需數小時的全基因分析流程減少到半小時,大幅提高病例的確診速度和準確率。
  針對新型冠狀病毒感染的肺炎病例,2月1日,浙江省疾病預防控制中心啟用自動化的全基因組檢測分析平臺,平臺由浙江省疾病預防控制中心、阿里達摩院醫療AI團隊和杰毅生物技術公司共同研發。通過AI診斷技術,可將原來數小時的疑似病例基因分析縮短至半小時。

  浙江省疾病預防控制中心微生物檢驗所博士孫逸介紹,快速、精確診斷對于當前的疫情控制尤為重要。新型冠狀病毒是基因組序列最長的病毒之一,快速檢測其基因組“全貌”非常困難,而臨床精準診斷又比較依賴這種基因信息。

  專家指出,目前全國大部分醫療機構和疾控部門,普遍采用核酸檢測方法來篩查病例,只能檢測到病毒基因的局部。一旦病毒發生變異,可能出現漏檢的情況。

  據悉,浙江此次啟用的全基因組檢測分析平臺可對病毒樣本進行全基因組序列分析比對,能夠有效防止病毒變異產生的漏檢,并將原需數小時的全基因分析流程減少到半小時,大幅提高病例的確診速度和準確率。

  具體來說,基于杰毅生物的新型設備,可以將患者樣本核酸提取、建庫和純化步驟可以在2小時內無人值守的完成;在基因分析階段,阿里巴巴達摩院針對新型冠狀病毒推出了多個算法模型。在序列比對過程中,達摩院對算法增加了分布式設計,有效提升比對效率;在病毒序列拼接階段使用分布式設計的deBruijn圖算法,變異病毒也能精準檢測。

  “該平臺基于阿里云的強大算力與達摩院新算法可以為病毒的解析提供支撐,基于該平臺,未來還可以在短時間內將檢測范圍覆蓋盡可能多的確診病例,也為后續疫苗與藥物研發打下堅實基礎!睂O逸說。

  目前有6個確診病例樣本,正在通過該平臺進行基因組序列的測定與分析。截至小編發稿前,這些樣本中檢測到的新型冠狀病毒與最早在武漢確診病人身上發現的病毒基因組序列高度同源。
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